MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 74307

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008340	ACC	2	6	23075	23080	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319185
502	NC_008340	CAC	2	6	23091	23096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319185
503	NC_008340	GCG	2	6	23137	23142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319185
504	NC_008340	CCT	2	6	23160	23165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319185
505	NC_008340	GAGG	2	8	23194	23201	25 %	0 %	75 %	0 %	114319185
506	NC_008340	GC	3	6	23207	23212	0 %	0 %	50 %	50 %	114319185
507	NC_008340	AGC	2	6	23213	23218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319185
508	NC_008340	CCA	2	6	23225	23230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319185
509	NC_008340	CGCGG	2	10	23254	23263	0 %	0 %	60 %	40 %	114319185
510	NC_008340	TCC	2	6	23279	23284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319185
511	NC_008340	CTT	2	6	23293	23298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319185
512	NC_008340	ATCTCG	2	12	23306	23317	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	114319185
513	NC_008340	TGA	2	6	23334	23339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319185
514	NC_008340	CGC	2	6	23346	23351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319185
515	NC_008340	CAGC	2	8	23352	23359	25 %	0 %	25 %	50 %	114319185
516	NC_008340	CTC	2	6	23407	23412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319185
517	NC_008340	ATG	2	6	23444	23449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319185
518	NC_008340	TCG	2	6	23450	23455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319185
519	NC_008340	CGGC	2	8	23459	23466	0 %	0 %	50 %	50 %	114319185
520	NC_008340	GCC	2	6	23467	23472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319185
521	NC_008340	TGG	2	6	23478	23483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319185
522	NC_008340	CTT	2	6	23506	23511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319185
523	NC_008340	GTC	2	6	23524	23529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319185
524	NC_008340	GCC	2	6	23578	23583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319185
525	NC_008340	GCA	2	6	23604	23609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319185
526	NC_008340	GCG	2	6	23617	23622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319185
527	NC_008340	ACC	2	6	23681	23686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319185
528	NC_008340	GAT	2	6	23722	23727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319185
529	NC_008340	CAG	2	6	23728	23733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319185
530	NC_008340	TTG	2	6	23738	23743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114319185
531	NC_008340	CAG	2	6	23761	23766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319185
532	NC_008340	GCA	2	6	23769	23774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319185
533	NC_008340	TCT	2	6	23793	23798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319185
534	NC_008340	GCA	2	6	23805	23810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319185
535	NC_008340	CTG	2	6	23845	23850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319185
536	NC_008340	GTT	2	6	23851	23856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114319185
537	NC_008340	TGA	2	6	23946	23951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319185
538	NC_008340	CCTT	2	8	23954	23961	0 %	50 %	0 %	50 %	114319185
539	NC_008340	GAT	2	6	23986	23991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319185
540	NC_008340	TCG	2	6	24005	24010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319185
541	NC_008340	TCG	2	6	24074	24079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319185
542	NC_008340	TGG	2	6	24090	24095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319185
543	NC_008340	CGG	2	6	24147	24152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319185
544	NC_008340	GTG	3	9	24203	24211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319185
545	NC_008340	CTGG	2	8	24235	24242	0 %	25 %	50 %	25 %	114319185
546	NC_008340	GC	3	6	24261	24266	0 %	0 %	50 %	50 %	114319185
547	NC_008340	TCC	2	6	24284	24289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319185
548	NC_008340	CG	3	6	24372	24377	0 %	0 %	50 %	50 %	114319185
549	NC_008340	TCA	2	6	24423	24428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319185
550	NC_008340	GGCG	2	8	24435	24442	0 %	0 %	75 %	25 %	114319185
551	NC_008340	TCG	2	6	24443	24448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319185
552	NC_008340	CGA	2	6	24522	24527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319186
553	NC_008340	CGT	2	6	24537	24542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319186
554	NC_008340	AGC	2	6	24557	24562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319186
555	NC_008340	GCGG	2	8	24636	24643	0 %	0 %	75 %	25 %	114319186
556	NC_008340	CAG	2	6	24658	24663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319186
557	NC_008340	CCA	2	6	24681	24686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319186
558	NC_008340	CGG	3	9	24708	24716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319186
559	NC_008340	CTC	2	6	24751	24756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319186
560	NC_008340	TGA	2	6	24768	24773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319186
561	NC_008340	CCG	2	6	25028	25033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319187
562	NC_008340	GC	3	6	25091	25096	0 %	0 %	50 %	50 %	114319187
563	NC_008340	TGG	2	6	25097	25102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319187
564	NC_008340	GCC	2	6	25114	25119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319187
565	NC_008340	GACT	2	8	25139	25146	25 %	25 %	25 %	25 %	114319187
566	NC_008340	CTG	2	6	25195	25200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319187
567	NC_008340	CGG	2	6	25211	25216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319187
568	NC_008340	AGC	2	6	25250	25255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319187
569	NC_008340	CGGG	2	8	25340	25347	0 %	0 %	75 %	25 %	114319187
570	NC_008340	ACG	2	6	25358	25363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319187
571	NC_008340	GCT	2	6	25467	25472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319188
572	NC_008340	TGC	2	6	25478	25483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319188
573	NC_008340	GC	4	8	25510	25517	0 %	0 %	50 %	50 %	114319188
574	NC_008340	CAG	2	6	25546	25551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319188
575	NC_008340	TCC	2	6	25556	25561	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319188
576	NC_008340	GAG	2	6	25567	25572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319188
577	NC_008340	CTG	3	9	25612	25620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319188
578	NC_008340	CTA	2	6	25641	25646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319188
579	NC_008340	CGG	2	6	25683	25688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319188
580	NC_008340	GAC	2	6	25732	25737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319188
581	NC_008340	CTT	2	6	25740	25745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319188
582	NC_008340	ACC	2	6	25753	25758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319188
583	NC_008340	TCC	2	6	25760	25765	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319188
584	NC_008340	GCG	2	6	25766	25771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319188
585	NC_008340	CGA	2	6	25809	25814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319188
586	NC_008340	CCG	2	6	25877	25882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319188
587	NC_008340	GTG	2	6	25916	25921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319188
588	NC_008340	CGG	3	9	25923	25931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319188
589	NC_008340	GGC	2	6	25933	25938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319188
590	NC_008340	CGGC	2	8	25943	25950	0 %	0 %	50 %	50 %	114319188
591	NC_008340	GAT	2	6	25998	26003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319188
592	NC_008340	CTT	2	6	26013	26018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319188
593	NC_008340	GCT	3	9	26028	26036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319188
594	NC_008340	CAGC	2	8	26097	26104	25 %	0 %	25 %	50 %	114319188
595	NC_008340	GCGG	2	8	26111	26118	0 %	0 %	75 %	25 %	114319188
596	NC_008340	GCT	3	9	26121	26129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319188
597	NC_008340	CT	3	6	26128	26133	0 %	50 %	0 %	50 %	114319188
598	NC_008340	CGG	2	6	26183	26188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319188
599	NC_008340	CCGG	2	8	26195	26202	0 %	0 %	50 %	50 %	114319188
600	NC_008340	CGC	2	6	26341	26346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319188
601	NC_008340	GGGC	2	8	26352	26359	0 %	0 %	75 %	25 %	114319188
602	NC_008340	GCT	2	6	26361	26366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319188
603	NC_008340	CCGGC	2	10	26417	26426	0 %	0 %	40 %	60 %	114319188
604	NC_008340	CGC	2	6	26433	26438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319188
605	NC_008340	ACC	2	6	26455	26460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319188
606	NC_008340	GGTC	2	8	26466	26473	0 %	25 %	50 %	25 %	114319188
607	NC_008340	GGCGCT	2	12	26478	26489	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	114319188
608	NC_008340	GCT	3	9	26520	26528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319188
609	NC_008340	CCG	3	9	26537	26545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319188
610	NC_008340	TGGA	2	8	26572	26579	25 %	25 %	50 %	0 %	114319188
611	NC_008340	TGC	2	6	26606	26611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319188
612	NC_008340	GAT	2	6	26628	26633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319188
613	NC_008340	GCCCTC	2	12	26659	26670	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	114319188
614	NC_008340	CTG	3	9	26677	26685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319188
615	NC_008340	GCT	2	6	26730	26735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319188
616	NC_008340	GGC	2	6	26766	26771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319188
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618	NC_008340	GCC	3	9	26785	26793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319188
619	NC_008340	TGG	2	6	26795	26800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319188
620	NC_008340	TCAGC	2	10	26820	26829	20 %	20 %	20 %	40 %	114319188
621	NC_008340	CGGA	2	8	26860	26867	25 %	0 %	50 %	25 %	114319188
622	NC_008340	GCAGGC	2	12	26919	26930	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	114319188
623	NC_008340	GCCG	2	8	26936	26943	0 %	0 %	50 %	50 %	114319188
624	NC_008340	GGACC	2	10	26994	27003	20 %	0 %	40 %	40 %	114319188
625	NC_008340	GGC	2	6	27024	27029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319188
626	NC_008340	GC	4	8	27084	27091	0 %	0 %	50 %	50 %	114319188
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